A la mort de Hughes, sa troupe continuera à tout de même à le soutenir, de plus, l'Achimiste au bras puissant, Alex Louis Armstrong, viendra les aider, ce qui sera très utile!
Pendant la guerre d'Ishbal, on lui ordonna de détruire tous les villages et de tuer tous ses habitants encore vivants. De plus, il fut obligé de d'assassiner deux médecins. La raison? Tout simplement parce qu'ils soignaient tout le monde, y compris les ennemis; de plus, ces deux docteurs était les parents de Winry. Tous ces évènements fit beaucoup souffrir Roy: après avoir tué M et Mme Rockbell, il voulut se suicider mais Marco l'en empêcha.
